发布时间：2月14日

摘要：在许多情况下，可以通过鉴定存在目的序列的环境壁ches来增强对核酸序列的生物学意义的跟踪。现在，可以使用许多宏基因组数据集，并对来自各种生物生态位的样品进行深度测序。尽管可以使用基于Web的工具轻松查询任何单个宏基因组数据集，但通过所有此类数据集进行元搜索的可能性较小。在此简短的交流中，我们演示了一种元元基因组方法，在NCBI序列阅读档案库中的所有高通量测序数据集中，通过关键词“ virome”访问与武汉冠状病毒2019-nCoV的紧密匹配。除了在2019-nCoV序列描述中观察到的与蝙蝠冠状病毒的同源性外（F.Wu等人2020，Nature，doi.org/10.1038/s41586-020-2008-3; P.Zhou等人2020， Nature，doi.org/10.1038/s41586-020-2012-7），我们注意到与Liu等人报道的从已故穿山甲的肺部生成的元病毒组数据集中的大量序列读数具有很强的同源性。 （病毒11:11，2019，http://doi.org/10.3390/v11110979）。我们的观察结果与对2019-nCoV的推论的讨论有关，并说明了元元基因组搜索工具在有效且快速表征潜在重要核酸序列中的实用性和局限性。

作者：Lamia Wahba, Nimit Jain, Andrew Z Fire,  ProfileMassa J Shoura, Karen L Artiles, Matthew J McCoy, Dae Eun Jeong

doi: https://doi.org/10.1101/2020.02.08.939660